Puedes crear una acción y ponerla a grabar, quitar con la herramienta parche todas las motas de un cielo mientras grabas, parar la acción y disparar esa acción con cada fotografía nueva que tengas que limpiar (tendrías que tener una para vertical y otra para horizontal y verificar el resultado).
En LR cuando le das a "ajustes de revelado/copiar ajuste" sobre una fotografía en la que hayas limpiado el cielo con la herramienta "eliminación de manchas", al usar el comando "ajustes de revelado/pegar ajuste" sobre otra foto, te copia toda la limpieza a la nueva foto.