Hago lo que Mdaf comenta en su último párrafo, revelo los Raws con Lightroom, luego los mando a PS (desde el propio LR, "editar en PS como panorámica") que lo tengo puesto que sea en 16bits. Y una vez unido quizás, sólo quizás le de un último toque en LR.
El resultado de la pano NUNCA va a ser Raw, con lo que para aprovechar la máxima calidad, el revelado lo tienes que hacer antes, y si tienes idea de hacerlo después… no deberías usar formatos de imagen que sean 8bits, y el JPEG lo es.