Tienes varias posibilidades y cada una es apropiada para determinadas fotos y para otras no. Piensa que tienes que jugar con dos exposiciones, la del primer plano, de la que se encarga el flash, y la del fondo, que corre por cuenta de la cámara. Puedes sumar ambas o quedarte sólo con la del flash.
Suponiendo que el flash está en modo e-TTL, si pones la cámara en AV, TV, o P, el flash iluminará el primer plano y el programa de la cámara elegirá la exposición para el fondo. De este modo todo quedará iluminado, pero si la exposición es larga te saldrán imágenes fantasma.
Si lo que quieres es congelar el movimiento, la mejor opción es poner la cámara en manual y elegir una velocidad rápida. De esta manera, dependiendo de las condiciones de luz, es posible que el fondo quede oscuro.
Lo mejor es que experimentes.
Saludos