Wenas.
Kelvin, a mí me pasó lo mismo con una 1D + 550EX. Se me ponía en 1/500 a f:22.
El problema sólo ocurrió usando un cable similar al Off Camera Shoe Cord 2 pero que sólo era compatible con las versiones anteriores (EOS-1N, EOS-5, etc.) Sólo me permitía usarlo en modo manual.
Quitado el cable acabó el problema y nunca volvió a repetirse. En ese caso era por incompatibilidad, pero en el tuyo puede ser algún problema del propio flash.
No creo que los tiros vayan por donde dice Avotes pues el diafragma se cierra a tope y la velocidad se pone a la más alta que sincronice, como si hubiera demasiada luz. ¿No?
¿Lo has probado en otra?
Salu2