Si las ves en el visor, una opción de perogrullo es que estén en este, por fuera, lo cual es facil de solucionar
Como supongo que no es eso, la otra opción es que estén en la pantalla de enfoque (quitas el objetivo, pones la cámara boca abajo y es eso que está ahí justo antes del pentaprisma). Así que podrías proceder a limpiarlo con cuidado (tampco va a ser más delicado que limpiar el sensor, digo yo)