Pues yo voy a llevaros la contraria ya que también tuve que resolver este dilema.
Todo depende del uso que pretendamos darle al cristal. El 70-200 es un excelente objetivo con una gran calidad óptica y una robustez L a prueba de bombas. Es un objetivo magnífico, pero si te gusta fotografiar con poca luz y sin flash, tendrás que renunciar a muchas fotos con él.
El 70-300IS tiene dos grandes ventajas, sus 100mm más de focal y, sobretodo, su fantástico IS que te permitirá fotografiar en condiciones de luz muy baja. Puedes afotar con una ventaja de 3 puntos EV por lo menos. Sus handicaps pasan por una menor robustez, una calidad óptica un poco inferior -muy poco- y un USM no tan rápido y silencioso aunque se defiende bien.
Un aviso, el IS sirve de bien poco para deportes ya que no congela los objetos en movimiento.
También tienes que considerar la aparatosidad del 70-200L con su peculiar color blanco frente a la discreción del 70-300, pero eso va a gustos.
Compres el que compres, de todos modos, quedarás satisfecho.
Saludos!