No estoy seguro de haber entendido lo que quieres hacer... si es conseguir que la herramienta de creación de panorámicas trabaje con los datos en bruto (RAW), combinándolos tal cual, eso me imagino que es imposible, porque sin duda la inmensa mayoría de herramientas de panoramización están pensadas para trabajar con muchos sub-formatos de imagen... RGB, escala de grises, CMYK, Lab, 8 bits, 16 bits, 32 bits, JPEG, TIFF, etc, etc... pero dudo que ninguno esté diseñado para trabajar con datos en bruto sin procesar.
Y, esencialmente por la misma razón, tampoco podrá guardar el resultado de la combinación panorámica en otro RAW.
Si lo que quieres es conservar la máxima calidad de post-procesado posible, seguramente te base con pre-procesar los RAWs guardándolos en TIFF de 16 bits, que sí lo admiten la inmensa mayoría de panoramizadores... AutoStitch, PTGui, Microsoft ICE, AutoPano... etc, etc.
Y si después quieres re-procesar el resultado, de hecho tanto Camera Raw como Lightroom hace tiempo que permiten procesar JPEGs y TIFFs de 8 y 16 bits; obviamente no tendrás todas las ventajas del RAW (concretamente, perderás el procesado de-mosaico, el ajuste de gamma y calibración), pero a efectos prácticos seguirás teniendo bastantes, sobre todo las relacionadas con el procesado de luminosidad y color y, si lo dejaste sin procesar en las fotos individuales de la panorámica, incluso la nitidez y el ruido.