Esa prueba no vale. Para comparar 2 cosas tienes que mantener las mismas condiciones, y ahí no se dan. Y, además, supongo que las fotos están tiradas en RAW, porque si están hechas en jpg interviene el postproceso que la cámara aplica a la foto y que es distinto en cada modelo, dependiendo de la orientación pro o amateur que tenga.
Pero, sobretodo, hay una cuestión que no has tenido en cuenta. En el número de Marzo, Chasseur D'Images publicó un estudio riguroso sobre la verdadera sensibilidad de varias reflex digitales y vino a confirmar lo que algunos ya habíamos comentado: que los valores nominales anunciados no siempre coinciden con los reales. A modo de resumen te pongo la siguiente gráfica:
Y verás que aunque uses el mismo valor ISO, realmente estás disparando con sensibilidades diferentes y, por tanto, con ruido diferente.