No soy un experto en Canon y no entiendo muy bien el esquema que pretendes (quién hace de trigger, quién de esclavo, y el método -infrarrojo, radio...-)
pero con el CLS de Nikon, que usa de maestro el de la cámara, lo que hago es poner éste en manual y bajarle la potencia a tope. a veces incluso el pongo algo que bloquee la luz directa. de ese modo hace de trigger, pero no afecta para nada a la imagen